thumb|250px|Flaga terytorium, będąca także flagą komisarza Komisarz Brytyjskiego Terytorium Oceanu Indyjskiego reprezentuje władzę brytyjską na tym terytorium. Jest on mianowany przez monarchę na wniosek Foreign and Commonwealth Office. Komisarz nie rezyduje na wyspach, gdzie nie ma stałych mieszkańców, lecz w Londynie.

Komisarz zarządzą terytorium w imieniu rządu, uchwala odpowiednie akty legislacyjne. Jest odpowiedzialny za kontakt z wojskami amerykańskimi i brytyjskimi z bazy wojskowej Diego Garcia.

Asystentem komisarza jest administrator, który także rezyduje w Londynie. Przedstawicielem komisarza na wyspach jest najstarszy rangą oficer brytyjski w bazie wojskowej Diego Garcia.

Brytyjskie Terytorium Oceanu Indyjskiego stało się odrębnym terytorium zamorskim w 1965. W latach 1965–1976 funkcję komisarza zawsze pełnił gubernator Seszeli. Od 1998 komisarz terytorium jest także komisarzem Brytyjskiego Terytorium Antarktycznego.

W przeciwieństwie do innych brytyjskich gubernatorów i komisarzy, komisarz BTOI nie posiada własnej flagi. Posługuje się oficjalną flagą terytorium.

Lista komisarzy OsobaKadencja#PortretImię i NazwiskoOdDo 1 Julian Edward George Asquith(1916–2011)8 listopada 19651967 2 Hugh Selby Norman-Walker(1916–1985)19671969 3 Bruce Greatbatch(1917–1988)19691973 4 Colin Hamilton Allen(1921–1993)197328 czerwca 1976 5 Norman Aspin(1922–2011)28 czerwca 19761976 6 Philip Mansfield(1926–2003)197617 września 1979 7 John Robson(1930–)17 września 19791982 8 Nigel Wenban-Smith(1936–)19821985 9 William Marsden(1940–)19851988 10 Richard Edis(1943–2002)19882 października 1991 11 Thomas George Harris(1945–)2 października 199128 stycznia 1994 12 David Ross MacLennan(1945–)28 stycznia 19941 lipca 1996 13 Bruce Dinwiddy(1946–)1 lipca 199617 lutego 1998 14 Christopher Edward John Wilton(1951–)17 lutego 199813 lipca 1998 15 John White(1946–)13 lipca 199823 kwietnia 2001 16 Alan Huckle(1948–)23 kwietnia 200112 stycznia 2004 17 Tony Crombie(1956–)12 stycznia 200431 lipca 2006 18 Leigh Turner(1958–)31 lipca 200623 czerwca 2008 19 Colin Roberts(1959–)23 czerwca 200817 października 2012 20 Peter Hayes(1963–)17 października 2012nadal Bibliografia Terytorium Oceanu Indyjskiego

*