Domena B3 – wysoce konserwatywna domena wiążąca DNA, spotykana wyłącznie w obrębie czynników transkrypcyjnych u roślin wyższych, znaleziona przynajmniej u 40 gatunków. Składa się z innych domen. Liczy sobie 100–120 reszt aminoacylowych. Zawiera 7 harmonijek beta oraz dwie helisy alfa, tworzące wiążącą DNA strukturę(), oddziałującą z rowkiem większym DNA.
Rodziny B3 U Arabidopsis thaliana występują 3 główne rodziny czynników transkrypcyjnych zawierające domenę B3: ARF (Auxin Response Factors) ABI3 (ABscisic acid Insensitive3) RAV (Related to ABI3/VP1)
białko ARF1-B3 ABI3-B3 RAV1-B3 struktura B3 pochodząca z modelowanie molekularne modelowanie molekularne NMR rozpoznawana przez B3 sekwencja TGTCTC CATGCA CACCTG
1WID i 1YEL to jedyne znane struktury fazowe domeny B3.
Pokrewne białka N-końcowa domena restrykcyjnej endonukleazy EcoRII; C-końcowa domena restryktazy BfiI posiada podobną strukturę wiążącą DNA.
Przypisy
Kategoria:Białka Kategoria:Genetyka molekularna