Filip Janusz Rybakowski (ur. 16 lipca 1973 w Poznaniu) – polski psychiatra, profesor nauk medycznych; profesor nadzwyczajny Katedry Psychiatrii Wydziału Lekarskiego II Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu.
Życiorys Pochodzi z rodziny osiadłej w Krotoszynie. Jego pradziadkiem był Władysław Rybakowski. Jego ojciec – Janusz Rybakowski – także jest profesorem psychiatrii związanym z poznańskim Uniwersytetem Medycznym.
Dyplom lekarski uzyskał na Akademii Medycznej w Poznaniu (obecnie Uniwersytet Medyczny) w 1997 i na tej uczelni zdobywał kolejne stopnie naukowe i awanse akademickie. Posiada specjalizację z psychiatrii (uzyskana w 2004) oraz psychiatrii dzieci i młodzieży (2007). Doktoryzował się w 2001 broniąc pracy pt. Ocena seropozytywności przeciw wirusowi choroby Borna w populacji polskich pacjentów z zaburzeniami psychicznymi, przygotowanej pod kierunkiem Andrzeja Rajewskiego.