W 1965 wyjechała na roczny pobyt do Instytutu Enzymologii (Institute for Enzyme Research) na Uniwersytecie Wisconsin w Madison. W przeddzień powrotu do Polski zmarła. Amerykańska agencja prasowa Associated Press doniosła, że popełniła samobójstwo, zażywając cyjanek potasu.Associated Press: Polish Professor’s Death Ruled Suicide, MADISON (AP) Według polskiego wywiadu, poniosła śmierć w tajemniczych okolicznościachNa kierunku głównego przeciwnika. Stenogramy narady rezydentów wywiadu MSW w krajach anglosaskich 16 sierpnia 1966, re. Władysław Bułhak i Andrzej Paczkowski, wyd. Instytut Studiów Politycznych Polskiej Akademii Nauk, Warszawa 2016, s. 145.
Była autorką 45 prac naukowych. Według wspomnienia pośmiertnego, opublikowanego w kwartalniku naukowym "Postępy biochemii" w 1966 r., była "jednym z czołowych biochemików polskich"”Ludmiła Szarkowska 1921-1965” w: ’’Postępy Biochemii’’, wyd. Państwowe Wydawnictwo Naukowe, zeszyt 2, tom XII, 1966, s. 269-270.