Katastrofa We wczesnych godzinach rannych 23 sierpnia 2017 dwie drewniane belki, wspierające część kościelnego sufitu zawaliły się, wyrywając w nim dziurę i niszcząc freski. Spadający gruz uszkodził marmurowy ołtarz, kilka ławek i część oświetlenia. Na szczęście nikt nie został ranny, gdyż kościół był w tym czasie pusty. Budynek został na jakiś czas zamknięty, chociaż nie było bezpośredniego niebezpieczeństwa dalszego zawalenia. Bank of Valletta obiecał pomoc przy naprawie szkód i przywróceniu kościoła do poprzedniego stanu.
Trzy tygodnie po katastrofie zbudowany został tymczasowy sufit. Plany trwałych prac naprawczych pierwotnie brały pod uwagę możliwość budowy kopuły, która była w oryginalnym projekcie kościoła, lecz nie została nigdy zbudowana, lecz badania wykazały, że konstrukcja kościoła nie jest wystarczająco mocna, by utrzymać wagę kopuły. Sufit został odbudowany, i artysta Adonai Camilleri Cauchi ma przykryć podwieszony sufit nowymi freskami.