W latach 1982–1985 obok kościoła wzniesiono zabudowania klasztoru i w latach 1987–92 Wyższego Seminarium Duchownego pw. św. Bonawentury, według projektu Zbigniewa Radziewanowskiego.
Architektura Nowy kościół jest budowlą murowaną, jednonawową, z wielobocznie zamkniętym prezbiterium, które powstało z dawnej kaplicy. Fasada zwieńczona jest strzelistym szczytem utworzonym przez strome dwuspadowe dachy nawy i kruchty. Do wejścia głównego do kościoła prowadzą dwa symetryczne biegi schodów. Wejście przykryte jest dodatkowym daszkiem. W podpiwniczeniu kościoła znajduje się kaplica dla wiernych z dostępem z zewnątrz.
Wnętrze Obecny ołtarz główny w latach 1966–68 zastąpił stary, neogotycki. W tym samym czasie ścianę apsydy ozdobiono mozaiką „Ostatnia Wieczerza” autorstwa W. Jastrzębskiego. W oknach prezbiterium znajdują się witraże z 1959 roku, autorstwa Reginy Rychłowskiej-Molińskiej: „Sygmatyzacja św. Franciszka”, „Święty Antoni”, „Dary Ducha Świętego”. Na ścianie prezbiterium (pierwotnie umieszczony w głównym ołtarzu kaplicy) umieszczony jest obraz przedstawiający św. Franciszka i św.