Od 1944 zajęcia odbywały się w przedwojennym gmachu Szkoły Powszechnej Nr 1 i Nr 2. W 1977 budynek ten zamknięto i przeznaczono do remontu; lekcje tymczasowo przeniesiono do obiektów Szkoły Podstawowej Nr 3. Wówczas też wybudowano nowy, obecny gmach liceum, który został połączony ze wspomnianym, starym budynkiem przedwojennym. W 1979 rozpoczęto zajęcia w nowo wybudowanym budynku, a wyremontowane obiekty przedwojenne przekazano Szkole Podstawowej Nr 2.
W latach 1986–1991 dokonano rozbudowy gmachu liceum, powiększając go m.in. o szereg sal lekcyjnych oraz halę sportową. 8 maja 1986 decyzją władz wojewódzkich szkoła otrzymała imię Organizacji Narodów Zjednoczonych. Telegram z życzeniami do placówki przesłał ówczesny Sekretarz Generalny ONZ.
W roku 2001 w związku z reformą systemu oświaty przy liceum utworzono placówkę gimnazjalną, noszącą nazwę Powiatowe Gimnazjum Nr 2. Obie szkoły funkcjonowały jako Zespół Szkół Ogólnokształcących w Biłgoraju. W 2019 w wyniku kolejnej reformy systemu oświatowego wchodzące w skład placówki gimnazjum przestało istnieć.