Rozwój Radomia 1945-1964 / [przewod. kom. red. Stefan Witkowski] ; Radomskie Towarzystwo Naukowe. Radom: Radomskie Towarzystwo Naukowe, 1965. Struktura przestrzenna miasta na przykładzie Radomia / Stefan Witkowski. Warszawa: „Arkady”, 1967. Radom : dzieje miasta w XIX i XX wieku / red. pracy zbiorowej Stefan Witkowski ; aut. Anna Apanowicz et al.] ; Radomskie Towarzystwo Naukowe. Warszawa: Państ. Wydaw. Naukowe, 1985.
Odznaczenia Jako wybitny radomianin otrzymał w 1978 roku nagrodę indywidualną I stopnia im. Jana Kochanowskiego za całokształt pracy społecznej i naukowej. Jego imieniem nazwano jedną z ulic Radomia. Wielokrotnie był laureatem konkursu Radomianin Roku. W 2010 r. z okazji 40-lecia istnienia Wydziału Ekonomicznego ówczesnej Politechniki Radomskiej (obecnie Uniwersytet Technologiczno-Humanistyczny im. Kazimierza Pułaskiego) nadano jednej z sal dydaktycznych imię Stefana Witkowskiego.