W drodze powrotnej w basenie stoczniowym „Orzeł” uderzył dziobem w ruchomy pomost. 30 września – 14 października dokowanie okrętu. 21 października – 1 listopada „Orzeł” przeszedł próby torpedowe w Den Helder. 12 listopada wyjście okrętu do bazy w Horten. 14 listopada – 30 listopada próby okrętu na wodach norweskich w Oslofiordzie; między innymi pomiary szybkości na mili pomiarowej i próby zanurzenia na głębokość 80 m. 2 grudnia powrót okrętu do stoczni. 22 grudnia wydokowanie okrętu
1939 20 stycznia okręt opuścił dok. 26 stycznia pomyślne zakończenie komisyjnych prób okrętu decydujących o jego przejęciu. 2 lutego uroczyste przekazanie okrętu stronie polskiej i podniesienie bandery. 5 lutego „Orzeł” opuścił Vlissingen i udał się do Gdyni. 7 lutego przybycie okrętu do Gdyni. 10 lutego uroczyste powitanie okrętu w Gdyni, przez przedstawicieli władz. Dokonano uroczystego odsłonięcia tablicy zamontowanej na kiosku okrętu informującej że okręt wybudowano ze składek Funduszu Obrony Morskiej. marzec-lipiec szkolenia i ćwiczenia załogi w osiągnięciu zdolności bojowej okrętu, 1 czerwca zastępcą dowódcy został kpt. mar. J. Grudziński, a 17 lipca „Orzeł” został okrętem flagowym dowódcy dywizjonu. 24 sierpnia mobilizacja alarmowa dywizjonu okr. podw., dokonano przeglądu mechanizmów, zatankowano paliwo, pobrano prowiant.