Prezesi Naczelnej Izby dr Jan Witalis Bączkiewicz (1923–1929) dr Witold Chodźko (1929–1934) prof. Mieczysław Michałowicz (1934–1939) ? (1945–1952) prof. dr hab. n. med. Tadeusz Chruściel (I kadencja, 1989–1993) dr n. med. Krzysztof Madej (II, III kadencja, 1993–2001) dr n. med. Konstanty Radziwiłł (IV, V kadencja, 2001–2010) dr n. med. Maciej Hamankiewicz (VI, VII kadencja, 2010–2018) prof. dr hab. n. med. Andrzej Matyja (VIII kadencja, 2018–2022) dr n. med Łukasz Jankowski (IX, X kadencja, od 2022)
Dodatkowo w 1938 powołano instytucję Naczelnej Izby Lekarsko-Dentystycznej, której prezesem został Julian Łączyński. Samorząd stomatologów uległ likwidacji podczas okupacji niemieckiej, podobnie jak samorząd lekarski.
Rzecznik Praw Lekarza Biuro Praw Lekarza powstało w 2010. Rzecznik Praw Lekarza jest powołany do obrony godności zawodu lekarza i obrony zbiorowych interesów lekarzy. Sprawy indywidualne rozpatrują rzecznicy praw lekarza w okręgowych izbach lekarskich. Wyjątkiem jest sytuacja, gdy naruszenie praw indywidualnego lekarza może mieć wpływ na całe środowisko. Rzecznik koordynuje aktywność pełnomocników do spraw zdrowia lekarzy i lekarzy dentystów powołanych przez okręgowe rady lekarskie.