Ołtarze boczne umieszczone są po obu stronach nawy kościoła. Ołtarz z lewej strony poświęcony jest Zwiastowaniu, na pamiątkę małego kościoła znajdującego się w przeszłości w tym miejscu. Obraz w ołtarzu jest również przypisywany Francesco Zahrze. Drugi ołtarz poświęcony jest Matce Bożej Światłości. Na obrazie przedstawiona jest Madonna, nad którą dwa anioły trzymają koronę. Przed Najświętszą Panną klęczy św. Jan Chrzciciel, którego obecność przypomina nam drugi kościół, w przeszłości stojący na tym miejscu. Po obu stronach obrazu znajdują się dwa kamienne anioły, które go utrzymują, ponad nim dwa inne z koroną w rękach.
W apsydzie, po obu stronach ołtarza, znajdują się balkoniki. Ich lokalizacja w pobliżu ołtarza jest wielce oryginalna.
Święta patronalne Wygląda na to, że w przeszłości w kościele św. Jakuba obchodzono kilka świąt patronalnych. Kiedy w 1745 biskup Alphéran de Bussan wizytował kościół, stwierdził, że w kościele obchodzone było coroczne święto patrona kościoła mszą świętą śpiewaną. Drugie święto, którym czczona była Matka Boża z Pilar, obchodzono 8 września.