W spalonym budynku, między innymi, poważnie uszkodzone zostały okna z witrażami, które wówczas zdemontowano. W 2002 roku trafiły one jako depozyt do muzeum we Fromborku, a w roku 2007 burmistrz Braniewa Henryk Mroziński przekazał je w darze do zbiorów muzealnych. Ich konserwację i rekonstrukcję przeprowadzono we wrocławskiej pracowni Sławomira Oleszczuka i odtąd są eksponowane w muzeum we Fromborku.
21 listopada 1994 roku obiekt został wpisany do rejestru zabytków pod pozycją 401/94.
22 czerwca 1998 przedwojenna mieszkanka Braniewa, Heide Neumann, przekazała władzom samorządowym ufundowany przez siebie witraż, celem ozdobienia okna na półpiętrze budynku. Później jej brat, Karl Diegner, niemiecki artysta rzeźbiarz i pisarz współczesny, ufundował drugi witraż do sąsiedniego okna, o czym informuje tabliczka zamieszczona obok witraży. Inicjatorem i koordynatorem całego przedsięwzięcia był Roman Grudziński, pracownik Urzędu Miasta w BraniewieWitraże z Niemiec [w:] IKAT. Gazeta Braniewska, 3 lipca 1998, s. 1, 16Braniewo. Ratuszowe witraże [w:] IKAT. Gazeta Braniewska, 10 lipca 1998, s.