struktura własnościowa NEB prezentowała się następująco: miasto Berlin – 67% Powiat Niederbarnim – 26% kraj związkowy Brandenburgia – 6% inne gminy – 1%.
Po II wojnie światowej i okupacji, a później podziale Niemiec, część sieci kolejowej wchodzącej w skład NEB została rozebrana przez wojska radzieckie, większość z pozostałej części linii została natomiast w granicach NRD. Część linii znalazła się jednak w granicach RFN, stąd połączenia na liniach transgranicznych zawieszono. W 1950 r. spółkę wcielono do Deutsche Reichsbahn, która przejęła połączenia na odcinkach w granicach NRD.
Po zjednoczeniu Niemiec, cała sieć dawnej Niederbarnimer Eisenbahn została ponownie połączona. W 1993 r. ponownie uruchomione zostały połączenia towarowe na trasie między Wilhelmsruh i Basdorf. W 1998 r., po zakończeniu fuzji spółek kolejowych Niemiec Wschodnich i Zachodnich, z Deutsche Bahn wydzielona została ponownie spółka Niederbarnimer Eisenbahn. W 2000 r. NEB zakupiła linie kolejowe Karow – Basdorf oraz Wensickendorf – Schmachtenhagen. W 2004 r. NEB wygrała przetarg organizowany przez Brandenburgię na obsługę połączeń na tzw. Heidekrautbahn, tzn. na trasie z Groß Schönebeck do Berlin-Wilhelmsruh. Do obsługi pociągów powołano spółkę-córkę NEB Betriebsgesellschaft mbH.