Sprawa doktoratu W 2023 r. Michał Piegzik zarzucił, że rozdział książki Pacyfik i Eurazja, oparty na doktoracie Bartosiaka, stanowi plagiat. Historyk Jarosław Centek doszedł niezależnie do podobnych wniosków w odniesieniu do innego rozdziału. Piegzik z grupą wolontariuszy przeanalizował następnie 8 z 11 rozdziałów książki i stwierdził, że ok. 73% jej treści zostało skopiowane ze źródeł anglojęzycznych. Raport wskazał też na fałszowanie przypisów, błędy merytoryczne i brak metodologii naukowej.
Komisja Etyki ISP PAN jednogłośnie wszczęła procedurę rewizji nadania stopnia doktora. Bartosiak nie zgodził się z zarzutami, przedstawiając opinie Tomasza Grossego i Damiana Flisaka na swoją obronę.
14 czerwca 2024 r. Rada Naukowa ISP PAN odebrała Bartosiakowi stopień doktora. Bartosiak zapowiedział odwołanie.
30 czerwca 2025 r. Rada Doskonałości Naukowej uchyliła decyzję ISP PAN, wskazując na nieprawidłowości formalne postępowania pierwszej instancji: powołanie komisji bez określenia czasu i zakresu umocowania, włączenie do niej ekspertów niebędących pracownikami organu oraz niewykluczenie biegłych, wobec których zachodziły przesłanki braku bezstronności.