Istnieją także nieduże społeczności prawosławnych, Kościoła Nowoapostolskiego oraz Świadków Jehowy.
W 1989 roku Madagaskar odwiedził papież Jan Paweł II.
Religie plemienne Około połowy ludności nadal praktykuje religie tradycyjną, której głównym elementem jest podkreślanie więzi między żywymi a umarłymi. Kultura malgaska koncentruje się na szacunku dla przodków, ze względu na przekonanie, iż martwi odgrywają ważną rolę w życiu żywych. Mimo że wierzą w stwórcę Zanahary, spędzają wiele czasu na modlitwach do duchów przodków. Istotną rolę odgrywa obrzęd pogrzebowy famadihana.
Islam mały|Meczet w Antsirabe Islam dotarł na Madagaskar w XIV wieku poprzez kolonie handlowe założone przez muzułmańskich kupców z Afryki Wschodniej. Osiedla muzułmańskie powstały na północno-zachodnim wybrzeżu Madagaskaru, a ich mieszkańcy nazywani byli Antalaotra, czyli ludzie zza oceanu, którzy zachowali swoje morskie tradycje. Arabowie mieli znaczący wpływ na kulturę malgaską, ponieważ wiele arabskich słów znalazło się w języku malgaskim. Większość z arabskiego dziedzictwa znajduje się w północno-zachodniej części wyspy, w regionie Majunga.