Śledztwo Policja otrzymała anonimową wskazówkę sugerującą udział w atakach gazowych Aum Shinrikyō, ale sekta nie została oficjalnie oskarżona o incydent. Stało się to dopiero po późniejszym ataku na tokijskie metro. Jeden z wniosków brzmiał: „Matsumoto zdecydowanie było swego rodzaju eksperymentem. Wynik tego eksperymentu na otwartej przestrzeni: siedmiu zabitych, ponad dwustu rannych. Jeśli sarin zostanie uwolniony w zamkniętej przestrzeni, powiedzmy, w zatłoczonym metrze, to łatwo wyobrazić sobie ogromną katastrofęGuinea Pigs FALSE PROPHET: THE AUM CULT OF TERROR (chapter 18), Patrick Bellamy".
Po incydencie policja skoncentrowała swoje śledztwo na Yoshiyukim Kōno, którego żona była w śpiączce na skutek ataku gazem. Odkryto, że Kōno przechowywał dużą ilość pestycydów w swojej rezydencji. Mimo że sarin nie może być wytwarzany z pestycydów, Keiichi Tsuneishi, japoński historyk, twierdził, że środek nerwowy można syntetyzować z pestycydów fosforoorganicznych, a Kōno został nazwany przez niektórych w mediach „trucicilem gazowym” i otrzymywał listy pełne nienawiści, groźby śmierci i intensywną presję prawną. Po poznaniu prawdy każda duża japońska gazeta przeprosiła Kōno, także te, które nie nazwały go podejrzanym.