Przebrana za mężczyznę pracowała jako lekarz w swoim rodzinnych Atenach. Wiele kobiet jednak nie chciało wizyt mężczyzn, szczególnie przy porodach, wtedy Agnodike rozchylała tunikę. W miarę jak rosła jej popularność wśród pacjentek, rywalizujący lekarze oskarżali ją o uwodzenie kobiet w Atenach, a nawet o rozpustę i gwałty. Została postawiona przed Areopagiem, gdzie wobec rady ujawniła swoją płeć ławie przysięgłych, podnosząc tunikę. Gest ten znany był w starożytnej Grecji jako anasyrma. Wtedy została oskarżona o nielegalną praktykę lekarską jako kobieta. W jej obronie wystąpiły kobiety z Aten, które chwaliły ją za jej skuteczne leczenie. Pod ich naciskiem została nie tylko uniewinniona, ale też wszystkie wolno urodzone Greczynki zostały dopuszczone do zgłębiania tajników położnictwa.
Historię Agnodike opisał rzymski pisarz Gajusz Juliusz Hyginus, żyjący w czasach Juliusza Cezara i Oktawiana Augusta. Spisał wiele greckich opowieści i zawarł je w dziele Fabulae. Wśród nich znalazła się również opowieść o Agnodike. Anegdotyczny charakter opowieści wskazywać może, że kobieta była raczej postacią mityczną, do czego skłania się wielu współczesnych badaczy. Tym bardziej, że jej imię, w dosłownym tłumaczeniu „czysta przed sprawiedliwością”.