Wewnątrz Pustej Ziemi zespół naukowców odnajduje ekosystem podobny do Wyspy Czaszki. Odkrywają salę tronową stworzoną przez przodków Konga, w której znajdują pozostałości starożytnej wojny jego gatunku z Godzillą oraz świecący topór. Gdy identyfikują źródło zasilania, zespół Apex przesyła swoje dane z powrotem do bazy w Hongkongu, pomimo protestów Ilene. Zwabiony aktywacją Mechagodzilli, Godzilla przybywa do Hongkongu i wyczuwając Konga, bezpośrednio wierci szyb do sali tronowej swoim atomowym oddechem. W wynikającym z tego chaosie Maia i zespół Apex próbują uciec, ale ich pojazd zostaje zmiażdżony przez Konga.
Ilene, Jia i Nathan udają się do Hongkongu, gdzie Godzilla i Kong walczą. Godzilla jest początkowo obezwładniony przez Konga, ale ze starcia wychodzi zwycięsko. Wielki goryl traci przytomność. Madison, Josh i Bernie zostają złapani przez ochronę i zabrani do Simmonsa. Pomimo obaw Rena o zmienność źródła zasilania, Simmons nakazuje mu aktywować Mechagodzillę. Maszyna wymyka się spod kontroli, zabija Simmonsa, poraża prądem Rena, a następnie atakuje Hongkong. Godzilla i Mechagodzilla walczą, ale Godzilla jest przytłoczony. Nathan ożywia Konga, a Jia przekonuje go, by pomógł Godzilli.