Znaczenie Kanał Sztolniowy był istotną częścią drogi wodnej łączącej kopalnie i huty na terenie Górnego Śląska z rzeką Odrą. Węgiel transportowany łodziami przez Główną Kluczową Sztolnię Dziedziczną miał być przeładowywany w porcie u wylotu sztolni i transportowany dalej barkami przez Kanał Sztolniowy, Kanał Kłodnicki do Odry. Był również ważnym elementem w systemie odwadniania kopalń – do niego odprowadzana była woda z Głównej Kluczowej Sztolni Dziedzicznej.
Z czasem okazało się, że kanał służy jedynie do transportu węgla na potrzeby huty w Gliwicach, w zawiązku z czym w 1824 rozebrano niewykorzystywaną pochylnię przy hucie (węgiel do portu w Gliwicach dostarczany był na wozach konnych). Na początku XX wieku przestarzały i nie modernizowany Kanał Kłodnicki stracił na znaczeniu, w 1933 podjęto decyzję o budowie nowej drogi wodnej (Kanał Gliwicki). Niedługo później (1936) całkowicie zaniechano transportu węgla Główną Kluczową Sztolnią Dziedziczną. Kanał Sztolniowy wyłączono z użytkowania i rozebrano część urządzeń na jego przebiegu. Dodatkowymi przyczynami zaprzestania żeglugi po kanale było jego łatwe zamulanie się i obawa, że poprzez pogłębienie kanału mogą być zalane wyrobiska kopalni Królowa Luiza w Zabrzu (poprzez Główną Kluczową Sztolnię Dziedziczną).