Od lipca Akademia Piłkarska została organizacyjnie przeniesiona ze struktur Towarzystwa Sportowego do piłkarskiej spółki Wisły, co zostało uchwalone w marcowym porozumieniu z pożyczkodawcami. Na stanowisko dyrektora mianowano Krzysztofa Kołaczyka. W ramach współpracy z Zespołem Szkół Ponadgimnazjalnych Małopolska Szkoła Gościnności im. Tytusa Chałubińskiego w Myślenicach, przy pozytywnej opinii władz wojewódzkich, krakowski klub utworzył dla adeptów licealną klasę o profilu sportowym, dostępną od roku szkolnego 2020/2021.

Koronawirus a Wisła Od 10 marca wstrzymano dystrybucję biletów na mecze krakowskiego zespołu z powodu decyzji organów administracyjnych, która nakładała obowiązek organizacji imprez masowych bez udziału publiczności w związku z ryzykiem rozprzestrzeniania się wirusa SARS-CoV-2 w Polsce. W dniach meczowych miały nie obowiązywać także akredytacje dla mediów zewnętrznych. Przed rozpoczęciem 27. kolejki Ekstraklasa SA podjęła jednak decyzję o zawieszeniu wszystkich spotkań w najwyższej klasie rozgrywkowej do końca marca. W kolejnym tygodniu decyzja o zawieszeniu rozgrywek została przedłużona do 26 kwietnia. Z powodu braku możliwości odbywania zajęć zespołowych sztab szkoleniowy podjął decyzję o przejściu do końca miesiąca na treningi indywidualne, ustalone z każdym zawodnikiem.