Przed rozpoczęciem sezonu podjęto decyzję o reaktywacji drugiej drużyny, którą z powodu oszczędnościowych rozwiązano w sierpniu 2016 roku. Koordynacją projektu zajął się Adrian Filipek, awansowany też na funkcję głównego trenera. Drużyna rezerw została dołączona przez Małopolski Związek Piłki Nożnej do zachodniej grupie małopolskiej IV ligi.

Sprzedaż karnetów na rundę zasadniczą i finałową rozpoczęto 29 maja.

20 czerwca stowarzyszenie „Socios Wisła Kraków” w tajnym głosowaniu członków przegłosowało decyzję o regularnym wsparciu klubu darowiznami pieniężnymi. Miesiąc wcześniej grupa udzieliła pomocy finansowej na przedłużenie kontraktu Marcina Wasilewskiego. W lipcu klub zawarł umowę ze stowarzyszeniem w sprawie strategicznej współpracy. Od startu sezonu na froncie koszulek pierwszej drużyny widnieje logo stowarzyszenia.

Po powołaniu Piotra Obidzińskiego na stanowisko wiceprezesa zarządu i tymczasowego prezesa wspólnie z grupą współpracujących z klubem przedsiębiorców ruszył projekt zewnętrznego źródła finansowania transferów. Budżet klubu na nowy sezon wyniósł 30 milionów złotych, a zaległości wobec wierzycieli 33 000 000 złotych.