Zmieniono również siedzibę Laboratorium, które ulokowano w nowoczesnych pomieszczeniach laboratoryjnych zlokalizowanych w Centrum Innowacyjno-Wdrożeniowym Nowych Technik i Technologii Uniwersytetu Przyrodniczego.
Siedziba Centralne Laboratorium Badawcze mieści się w budynku Centrum Innowacyjno-Wdrożeniowego Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie przy ul. Głęboka 28, 20-612 Lublin.
Lokalizacja laboratorium wielokrotnie zmieniała w okresie jego funkcjonowania. Początkowo zlokalizowane było przy ul. Akademickiej 13. Z uwagi na trudności lokalowe rozbudowującego się Uniwersytetu w 2009 przeniesione zostało do powstałego Lubelskiego Parku Naukowo-Technologicznego, który zapewnił nowoczesną bazę lokalową. Rozbudowa bazy lokalowej Uczelni, pozwoliła w roku 2019 na przeniesienie Laboratorium do budynku Centrum Innowacyjno-Wdrożeniowego Uniwersytetu przyrodniczego w Lublinie.
Pracownie Badawcze Pracownia Wysokosprawnej Chromatografii Cieczowej Pracownia Analizy Wód Pracownia Chromatografii Gazowej i Spektrometrii Mas Pracownia Badań Środowiskowych Pracownia Atomowej Spektrometrii Emisyjnej i Analizy Rentgenowskiej Pracownia Analizy Podstawowych Składników Odżywczych Pracownia Absorpcyjnej Spektrometrii Atomowej Pracownia Mikroskopii Optycznej i Elektronowej