Mitochondrialne kanały jonowe – białka błonowe umożliwiające przepływ jonów przez wewnętrzną i zewnętrzną błonę mitochondrialną, gwarantując prawidłowe funkcjonowanie komórek w warunkach fizjologicznych. Wnętrze mitochondriów, zwane macierzą mitochondrialną otoczone jest dwiema błonami wewnętrzną i zewnętrzną, pomiędzy którymi znajduje się przestrzeń międzybłonowa. Wiedza na temat rozmieszczenia poszczególnych mitochondrialnych kanałów jonowych w tkankach jest bardzo fragmentaryczna, ponieważ wymaga nie tylko danych na temat ekspresji genu kodującego dany kanał, ale także badania dystrybucji subkomórkowej produktu genowego i korelacji tej informacji z aktywnościami kanału obserwowanymi w eksperymentach patch-clamp. Wszystko to jest trudne, zwłaszcza biorąc pod uwagę niski poziom ekspresji i istnienie różnych wariantów splicingu, którego mechanizm importu do mitochondriów nie jest zrozumiały. Zasadniczo wszystkie dotychczas zidentyfikowane mitochondrialne kanały potasowe są odpowiednikami dobrze znanych kanałów błony komórkowej.