Jan-Werner Müller (ur. 1970 w Bad Honnef) – niemiecki historyk i politolog.
Życiorys Urodził się w 1970 roku. Studiował na Wolnym Uniwersytecie Berlińskim, University College London, St Antony’s College w Oksfordzie i Princeton University. Od 1996 do 2003 r. był pracownikiem All Souls College w Oksfordzie, następnie do 2005 r. Modern European Thought w European Studies Centre przy St. Antony’s College. Od 2005 wykłada na Wydziale Politologii Princeton University. Jest członkiem School of Historical Studies przy Institute of Advanced Study na Princeton University, wykładowcą wizytującym na Collegium Budapest Institute of Advanced Study, Collegium Helsinki, Instytucie Remarque'a, Uniwersytecie Nowojorskim, Center for European Studies, Harvard University, Robert Schuman Centre for Advanced Studies, European University Institute we Florencji. Jako profesor wizytujący wykładał na Ecole des Hautes Etudes en Sciences Sociales w Paryżu, Ludwig Maximilians-Universitaet w Monachium, Humboldt Universitaet w Berlinie, Institut d'Etudes Politiques w Paryżu i Uniwersytecie Pekińskim. Współzałożyciel European College of Liberal Arts, pierwszej prywatnej, anglojęzycznej uczelni w Niemczech, na której pełnił funkcję dyrektora.