Losowanie par 1/16 finału odbyło się 16 grudnia 2019 roku. Zwycięzcy fazy grupowej Ligi Europy oraz 4 najlepsze z zespołów, które zajęły 3. miejsca w fazie grupowej Ligi Mistrzów zostali rozlosowani przeciwko zespołom, które zajęły 2. miejsca w fazie grupowej Ligi Europy oraz pozostałym drużynom, które zajęły 3. miejsca w fazie grupowej Ligi Mistrzów. Drużyny z tych samych federacji oraz grup nie mogły zostać zestawione w jednej parze (dotyczy jedynie 1/16 finału).
Drużyny rozstawione
Drużyny nierozstawione
Drużyny, które awansowały z fazy grupowej Ligi Europy:
GrupaZwycięzcy grup2. drużyny grupA Sevilla FC APOEL NikozjaB Malmö FF FC KopenhagaC FC Basel Getafe CFD LASK Linz Sporting CPE Celtic CFR ClujF Arsenal Eintracht FrankfurtG FC Porto RangersH RCD Espanyol Łudogorec RazgradI KAA Gent VfL WolfsburgJ İstanbul Başakşehir RomaK SC Braga Wolverhampton WanderersL Manchester United AZ Alkmaar
Zespoły, które odpadły z fazy grupowej Ligi Mistrzów: GrupaDrużynaH Ajax6312126+610E Red Bull Salzburg62131613+37F Inter Mediolan6213109+17G SL Benfica62131011-17D Bayer Leverkusen620459-46C Szachtar Donieck6132813-56B Olympiakos SFP6114814-64A Club Brugge6033412-83
1/16 finału Losowanie par tej rundy odbyło się 16 grudnia 2019 roku.