Służba 18 grudnia 1916 roku SM UC-56 został przyjęty do służby w Cesarskiej Marynarce Wojennej, a jego dowództwo objął kpt. mar. (niem. Kapitänleutnant) Johannes Remy. 1 lutego 1917 roku nowym dowódcą UC-56 został kpt. mar. rez. (niem. Kapitänleutnant der Reserve) . Po okresie szkolenia okręt został 20 sierpnia 1917 roku przydzielony do Flotylli Bałtyckiej. W październiku 1917 roku SM UC-56 (wraz z bliźniaczymi jednostkami UC-57, UC-58, UC-59, UC-60 i UC-78) w składzie flotylli „Kurlandia” wziął udział w operacji Albion, mającej na celu opanowanie Wysp Moonsundzkich. W pierwszej dekadzie października okręt wyszedł z Lipawy z zadaniem obserwacji rejonu na zachód od wyspy Hiuma oraz postawienia zagród minowych na rosyjskich szlakach wodnych; do bazy powrócił między 20 a 25 października. thumb|left|UC-56 po internowaniu w Santander 10 grudnia 1917 roku UC-56 został przydzielony do Flotylli Flandria. Wieczorem 26 lutego 1918 roku U-Boot w odległości 10 Mm na zachód od wyspy Lundy storpedował bez ostrzeżenia zbudowany w 1900 roku brytyjski okręt szpitalny o pojemności  BRT, płynący w pełnym oświetleniu z prędkością 10 węzłów z Newport do Brestu w celu zabrania rannych. Na jego pokładzie znajdowało się 122 członków załogi i 64 osoby personelu medycznego.