Wyprodukowano 1610 egzemplarzy. C-46E Commando Samolot do transportu dużych ładunków, wyposażony w duże drzwi z boku kadłuba. Wyprodukowano 17 egzemplarzy. C-46F Commando Samolot do transportu dużych ładunków, wyposażony w drzwi po obu stronach kadłuba. Wyprodukowano 234 egzemplarzy. C-46G Commando Jeden samolot wyposażony w eksperymentalne szyby i kwadratowe skrzydła. C-46H C-46J AC-46K Commando Wersja z silnikami Wright R-3350-BD. Projekt niezrealizowany. XC-46K XC-46L Trzy samoloty wyprodukowane w 1945 i wyposażone w silniki Wright R-3350. XC-113 Jeden C-46G przekształcony w samolot testowy z silnikami General Electric T31. Nigdy nie został oblatany. R5C-1 Samolot transportowy US Marine Corps. Wyprodukowano 160 egzemplarzy.
Użytkownicy samolotów C-46 na świecie Wojskowi
Boliwijskie Siły Powietrzne
Brazylijskie Siły Powietrzne
Siły Powietrzne Republiki Chińskiej
Korpus Powietrzny Haiti
Siły Powietrzne Izraela
Japońskie Powietrzne Siły Samoobrony
Kolumbijskie Siły Powietrzne – jeden samolot
Siły Powietrzne Republiki Korei
United States Army Air Forces United States Air Force United States Marine Corps United States Navy
Radzieckie Siły Powietrzne – jeden samolot.
Cywilni
Austral Líneas Aéreas Aeroplan Aerotransportes Litoral Argentino (ALA)