Następnie okazało się, że właściciel, Biuro Reprezentacji Rządowej w Sprawach Majątkowych ( – ÚZSVM), domagał się eksmisji budynku, ponieważ był przeznaczony do innego użytku, chociaż w rzeczywistości nie zostało wydane żadne zezwolenie.

Atak Po demonstracjach za, jak i przeciw migracji 6 lutego 2016, Klinika została zaatakowana przez grupę ponad dwudziestu neofaszystów oraz neonazistów. Następnego dnia odbyła się demonstracja solidarnościowa z udziałem 400 osób. Rzecznik Kliniki powiedział: „Wysłaliśmy 150 samochodów z ubraniami i innymi rzeczami na Węgry, do Chorwacji oraz Serbii - gdziekolwiek mogliśmy pomóc. W Czechach nie mamy wielu uchodźców, więc Klinika działa jak piorunochron na gniew w czeskim społeczeństwie”. Orzeczeniem sądu ośrodek zamknięto, ale w wyniku odwołania został ponownie otwarty po kilku tygodniach.

Eksmisja W styczniu 2019 została dokonana eksmisja budynku, pomimo politycznego wsparcia dla Kliniki wyrażonego przez Czeskich Młodych Zielonych oraz Ruchu Demokracji w Europie 2025.