Uczestnik kampanii wrześniowej (1–17 września 1939). Współpracował ze Związkiem Walki Zbrojnej. W Armii Krajowej pod pseudonimem „Tusz” zajmował się podrabianiem dokumentówMacur. A., Gdańsk Kazimierza Macura. Z historii konserwacji i odbudowy zabytków w latach 1936–2000, s. 19–22, Fundacja Terytoria Książki, Gdańsk, 2016..
W 1940 roku z ramienia Jana Borowskiego prowadził prace związane z częściową rekonstrukcją zamku na wyspie w Trokach. W latach 1940–1941 w Biurze Projektów Przemysłowych w Wilnie wykonał plany inwentaryzacyjne budynków przemysłowych w Wilnie, Landwarowie i Nowej Wilejce oraz kilku budynków mieszkalnych w Wilnie. W latach 1941–1942 na zlecenie Muzeum Kultury im. Witolda Wielkiego w Kownie wykonał pomiary i plany inwentaryzacyjne kościoła św. Anny w Wilnie. W okresie od lipca 1942 do maja 1943 roku, pracując jako technik budowlany w Urzędzie Powiatowym w Postawach, został przeniesiony do Przemysłowo-Budowlanego Oddziału Zarządu Rejonowego w Duniłowiczach, gdzie wykonał projekt odbudowy i adaptacji klasycystycznego pałacu Ogińskich w Łuczaju na Szkołę Rolniczą. Podczas pracy w Urzędzie Ochrony Zabytków Kultury w Wilnie w latach 1943–1944 wykonał plany inwentaryzacyjne kościoła pod wezwaniem Nawiedzenia Najświętszej Panny Marii i zamku lądowego w TrokachMacur. A., Gdańsk Kazimierza Macura.