Klasztor został dwukrotnie zniszczony, pierwszy raz podczas napadu husytów w 1420 r. a drugi raz w czasie wojny trzydziestoletniej w 1639 r. Cesarz Józef II Habsburg w 1785 r. zlikwidował klasztor, a w jego zabudowaniach stworzył rafinerię cukru. W 1935 r. Bulgakov utworzył w Zbraslaviu muzeum przeznaczone dla rosyjskich emigrantów, które zostało zamknięte, a dobra skonfiskowane przez komunistów przed 1948 r. Miasto zostało włączone do Pragi w 1974 r., dziś stanowi dzielnicę przede wszystkim mieszkalną. W 1991 r. szczątki Przemyślidów po wielu latach zostały na nowo pochowane w bazylice św. Jakuba. Do 2009 r. Galeria Narodowa w Pradze eksponowała w zabudowaniach klasztoru zbiory sztuki chińskiej i japońskiej.https://web.archive.org/web/20141016123550/http://www.zbraslavhistorie.info/index_cz.php (czeski) [dostęp 2014-10-09].
W Zbraslaviu mieszkał Jaromír Vejvoda, znany jako twórca popularnej w czasie II wojny światowej melodii Modřanská polka (po napisaniu słów znana jako Škoda lásky, polski tytuł Banda). Na jego domu przy zbraslavskim Rynku, zwanym "U Vejvodů", dziś znajduje się tablica pamiątkowa poświęcona artyście, zaś we wnętrzu – restauracja pod nazwą "Škoda lásky".