Podczas przewodzenia Federalnej Służbie Podatkowej zyskał wśród rosyjskich mediów miano dobrego administratora oraz technokraty.
Premier Rosji mały|Michaił Miszustin podczas przesłuchania w Dumie, 16 stycznia 2020 15 stycznia 2020, po rezygnacji Dmitrija Miedwiediewa, Prezydent Federacji Rosyjskiej Władimir Putin desygnował go na urząd premiera Federacji Rosyjskiej. Dzień później Duma Państwowa Federacji Rosyjskiej zatwierdziła jego kandydaturę. Tego samego dnia prezydent Rosji powołał dekretem Miszustina na stanowisko premiera.
Pierwszy raz od czasu rozpadu ZSRR podczas głosowania nie było przeciwnych kandydatowi na ten urząd. + Wyniki głosowania za powołaniem na premiera Michaiła MiszustinaPartiaCzłonkowieZaPrzeciwkoWstrzymali sięNieobecniInneZjednoczona Rosja 341 326 0 0 15Komunistyczna Partia Federacji Rosyjskiej 43 0 0 41 2LDPR 40 39 0 0 1Sprawiedliwa Rosja 23 17 0 0 6Rodina 1 1 0 0 0Platforma Obywatelska 1 0 0 0 1Wszystkie partie 449 383 0 41 25 1Wakat na stanowisku parlamentarzysty.
28 stycznia 2020 Aleksiej Nawalny opublikował film, w których oskarża Michaiła Miszustina o korupcję obejmującą miliardy rubli. 30 stycznia 2020 r.