W 1999 roku część przestrzeni magazynowej udało się zaadaptować na cele wystawiennicze, powstał w niej „Salon Młodych” dziś jest to „Mały Salon” - sala ekspozycyjna o powierzchni 50 mkw.
Wystawy Galeria każdego roku organizuje ok. 20 indywidualnych wystaw znanych i wybitnych twórców, które prezentują różne postawy i formy artystyczne obecne w sztuce współczesnej. Swoją twórczość w Galerii prezentowało wielu polskich artystów, m.in.: Zdzisław Beksiński, Bronisław Chromy, Marian Czapla, Jerzy Duda-Gracz, Edward Hartwig, Władysław Hasior, Stanisław Kulon, Franciszek Maśluszczak, Jerzy Nowosielski, Stanisław Rodziński, Jan Sawka, Andrzej Strumiłło, Józef Wilkoń, Zdzisław Witwicki, Barbara Zbrożyna, Gustaw Zemła. Instytucja realizuje również wiele zdarzeń o charakterze artystycznym i edukacyjnym.
We współpracy z Urzędem Miasta Włocławek realizuje Dni Włocławka, Bulwar Sztuki oraz plastyczne warsztaty profilaktyczno-twórcze: „Sztuka zamiast …”.
Od 1994 r. w Galerii Sztuki Współczesnej odbywa się:
Triennale Plastyki Włocławskiej - konkurs artystycznej