Rozgrywka SpellForce 3 to gra fabularna z elementami strategii czasu rzeczywistego. Gracz kontroluje stworzonego przez siebie bohatera oraz maksymalnie trzech kompanów, którzy charakteryzują się własnymi zestawami umiejętności. Podobnie jak w innych grach fabularnych postacie mogą zostać wyposażone różne przedmioty które wpływają na ich zdolności oraz skuteczność w walce. W pewnych momentach rozgrywki gracz musi zbudować bazę operacyjną, aby móc wydobywać surowce i tworzyć jednostki potrzebne do zlikwidowania dużych grup przeciwników i wykonania określonych celów.
W grze dostępny jest fabularny tryb kampanii i tryb potyczki, w którym gracz toczy bitwę i rekrutuje jednostki zbudowane w bazie. Oba tryby mogą być rozgrywane przez jednego gracza lub przez kilku połączonych przez internet. W trybie potyczki gracze mogą grać w jednej drużynie dzieląc się zadaniami.
W trybie kampanii gracze mogą stworzyć własnego bohatera określając jego wygląd i płeć oraz trzy grupy umiejętności, którymi będzie się posługiwał w walce. Postać gracza otrzymuje także czwartą grupę umiejętności o nawie "Przywództwo", która zawiera zdolności przydatne podczas toczenia bitew.