Wybór publikacji 1887 Atlas rostlinstva pro školu a dům 1889 Květena českého cenomanu, 1889–90; 1891 Flora Bulgarica I–II, 1891; 1897 Mechy české 1903 Játrovky české I–III, 1901–03; 1907 Srovnávací morfologie rostlin, 1905; 1920 Přírodní filosofie I (díl přírodnický) 1922 Přírodní filosofie II (díl kulturní) 1926 Systematická botanika I–VI, 1922–26; 1931 Flora cretacea I–IV, 1926–31; 1928 Obrázky 1932 Literární studie 1934 Monographia Discomycetum Bohemiae I–II 1935 Poslední moudrost čili Nauka o kosmickém duchovnu 1882. Die Flora der böhmischen Kreideformation 1886 Beiträge zur Kenntniss der bulgarischen Flora 1891 Flora Bulgarica. Descriptio … systematica plantarum vascularium in principatu Bulgariae sponte nascentium 1892 O biologii a morfologii rodu Monesis, etc. 1892 O morfologii rostlin cevnatých tajnosnubných, etc. Boh. & Ger 1892 O Phyllokladiích rodu Danaë, etc.