Szwagrzyk, J., & Gazda, A. (2007). Above‐ground standing biomass and tree species diversity in natural stands of Central Europe. Journal of vegetation Science, 18(4), 555-562.
Szwagrzyk, J., Szewczyk, J., & Maciejewski, Z. (2012). Shade-tolerant tree species from temperate forests differ in their competitive abilities: A case study from Roztocze, south-eastern Poland. Forest ecology and management, 282, 28-35.
Członkostwo w organizacjach Jest członkiem Polskiego Towarzystwa Botanicznego (od 1985 r.) oraz International Association for Vegetation Science (od 1989 r.). Od roku 1996 (z trzyletnią przerwą w latach 1999-2002) należy do Komitetu Ekologii PAN. Od roku 2008 jest członkiem Komitetu Nauk Leśnych PAN oraz Komitetu Ochrony Przyrody PAN. W latach 1993–2012 był członkiem redakcji "Wiadomości Ekologicznych" , a od roku 2003 w "Polish Journal of Ecology". W latach 1991–1994 był członkiem Rady Naukowej Ojcowskiego Parku Narodowego, od 2003 Babiogórskiego Parku Narodowego, a od 2012 Tatrzańskiego Parku Narodowego (której to radzie obecnie przewodniczy). W latach 1996–1998 był koordynatorem operatu ochrony ekosystemów w projekcie Planu Ochrony Babiogórskiego Parku Narodowego. W latach 2003–2012 należał do Naukowego Centrum Badań Ekologicznych PAN i Rady Naukowej Instytutu Badawczego Leśnictwa w Warszawie.