Fundusz JCI Venture odegrał istotną rolę w rozwoju ekosystemu life science w Małopolsce. W latach 2009–2013 zainicjował działalność kilkunastu innowacyjnych spółek, działających m.in. w obszarach specjalistycznych usług badawczych, rozwoju leków innowacyjnych i generycznych oraz wyrobów i technologii medycznych. Doświadczenie zespołu zarządzającego funduszem oraz osiągnięcia inwestycyjne przyczyniły się do uzyskania zaufania Narodowego Centrum Badań i Rozwoju, które pod koniec 2017 roku przyznało JCI kolejne środki na inwestycje realizowane w ramach programu BRIdge Alfa.
W latach 2025–2028 Jagiellońskie Centrum Innowacji realizuje projekt „EFEKTywna współpraca dla lepszej Małopolski - program akceleracji startupów” (EFEKT), którego celem jest wspieranie rozwoju i wdrażania innowacyjnych rozwiązań we współpracy z partnerami biznesowymi. Projekt prowadzony jest przez Jagiellońskie Centrum Innowacji we współpracy z Fundacją Klaster LifeScience Kraków oraz Startup Advisory Sp. z o.o. Projekt jest realizowany w ramach Funduszy Europejskich dla Małopolski 2021–2027, Priorytet1. Fundusze europejskie dla badań i rozwoju oraz przedsiębiorczości, Działanie1.13 Wsparcie dla firm we wczesnej fazie rozwoju, typ A programy rozwojowe dla startupów.