Istotnym elementem oferty laboratorium jest wsparcie eksperckie w zakresie doboru, rozwoju i optymalizacji metod analitycznych, dostosowanych do specyfiki badanych substancji oraz celu projektu. Zespół laboratorium realizuje zarówno standardowe analizy rutynowe, jak i bardziej złożone projekty analityczne wymagające indywidualnego podejścia, wysokiej czułości oraz powtarzalności wyników. Laboratorium Analiz Instrumentalnych pełni także rolę zaplecza analitycznego dla pozostałych laboratoriów JCI, w szczególności Laboratorium Kontroli Jakości, Laboratorium Analiz Spektroskopowych oraz Laboratorium Analiz Biologicznych, oferując klientom możliwość realizacji kompleksowych projektów badawczych w ramach jednej, zintegrowanej infrastruktury. Takie podejście zapewnia spójność danych analitycznych, skrócenie czasu realizacji badań oraz efektywne wsparcie procesów R&D i kontroli jakości. Laboratorium Analiz Spektroskopowych - realizuje zaawansowane badania z zakresu identyfikacji i charakterystyki strukturalnej związków chemicznych oraz analizy powierzchniowej materiałów. Laboratorium stanowi zaplecze eksperckie dla projektów badawczo‑rozwojowych, kontroli jakości oraz prac aplikacyjnych prowadzonych w obszarze farmacji, biotechnologii i chemii.