W 1944 roku napisała sztukę historyczną Karl Stuart, która nigdy nie została wystawiona. Rok później napisała Der starke Stamm. Spotkany w 1950 roku w Monachium Brecht pomógł jej w realizacji ostatniej sztuki w teatrze, w radiu i telewizji. Kariera pisarska Fleißer nabrała tempa po śmierci męża w 1958 roku. W 1963 roku ukazał się zbiór opowiadań Avantgarde, przy czym opowiadanie tytułowe było portretem młodego Brechta. Pod koniec lat 60. XX w. utwory Fleißer odkryli ponownie dla sceny teatralnej młodzi reżyserzy Rainer Werner Fassbinder (1945–1982), Franz Xaver Kroetz i Martin Sperr (1944–2002). Na początku lat 70. Fegefeuer jest wielokrotnie wystawiany w Ingolstadt, a w 1972 roku wydawnictwo Suhrkamp Verlag wydało w trzech tomach dzieła zebrane pisarki. W 1989 roku powstał tom czwarty, a w 2001 roku tom piąty z korespondencją artystki.

Fleißer zmarła 2 lutego 1974 roku w Ingolstadt.

Dzieła Lista wybranych utworów za stroną Stadtmuseum Ingolstadt: 1923 – Meine Zwillingsschwester Olga 1925 – Fegefeuer in Ingolstadt 1928 – Pioniere in Ingolstadt 1928 – Ein Pfund Orangen 1930 – Tiefseefisch 1931 – Mehlreisende Frieda Geier.