Kościół Ta' Duna miał wielkie poważanie wśród mieszkańców. Baliw F.D. Antonio Sauna de Martenugno ufundował dlań adamaszkowe ozdoby na okazje świąteczne. W 1685 kanonik Antonio Famucelli podarował marmurowy posąg Najświętszej Panienki, zaś w 1694 przeznaczył niewielki kapitał na opłacanie mszy świętych podczas siedmiu głównych świąt Matki Bożej.
W 1744 biskup Paul Alphéran de Bussan wizytował kościół, zostawiając jego dokładny opis. Od tamtego czasu nie uległ on znaczącym zmianom.
Z czasem fiesta w święto patronalne odbywała się coraz rzadziej, by w XIX wieku zostać całkowicie zapomnianą. Doszło do tego, że nieformalnie zmieniono wezwanie kościoła, zaczęto go nazywać kościołem Niepokalanego Poczęcia. Z początkiem XX wieku świątynia została opuszczona. Podczas II wojny światowej, praktycznie pozbawiony wszelkich sprzętów liturgicznych, budynek przejęty został przez Air Raid Precautions (obrona cywilna przed nalotami bombowymi). Kilka lat po wojnie opiekę nad kościołem objął o. Karm Ċappara, a następnie kanonik ks. Vinċens Galea. Doprowadził on do odnowienia kościoła i udostępnienia go ogółowi. W grudniu 1991 kościół przekazany został Legionowi Maryi, który organizuje tutaj swoje spotkania, a także udziela się wśród turystów odwiedzających świątynię.