Proces aplikacji Po wybudowaniu Areny Toruń bezskutecznie ubiegał się o organizację mistrzostw Europy w roku 2019 roku przegrywając minimalnie z Glasgow. Miasto było też zainteresowane organizacją halowych mistrzostw świata w sezonie 2020, jednak przegrało z Nankinem. Niezależnie Toruń kandydował do organizacji mistrzostw Europy w sezonie 2021, a jego rywalem było holenderskie Apeldoorn. Polska kandydatura była szeroko promowana hasłem Time for Toruń, a do wspierania oferty włączyło się wielu lekkoatletów z Polski i innych krajów. Toruń został wybrany na gospodarza wydarzenia 27 kwietnia 2018 roku podczas posiedzenia Rady European Athletics w Berlinie. Polska kandydatura wygrała z holenderską w stosunku głosów 11 do 4.
Przygotowania W listopadzie 2019 roku miasto Toruń, Polski Związek Lekkiej Atletyki oraz Kujawsko-Pomorski Związek Lekkiej Atletyki podpisały porozumienie dot. organizacji wydarzenia. Rok przed rozpoczęciem mistrzostw zorganizowano konferencję prasową, na której oficjalnie poinformowano, że pierwszym ambasadorem mistrzostw został Paweł Wojciechowski. Tego samego dnia w Arenie Toruń oficjalnie uruchomiono zegar odliczający czas do zawodów i ogłoszono, że niebawem zostanie rozpisany konkurs na maskotkę mistrzostw.