Piłkarze pierwsze mecze rozegrali już 12 i 13 maja 1940, podczas czterodniowego miejskiego turnieju piłkarskiego, przeciwko drużynom złożonym ze stacjonujących w Toruniu żołnierzy piechoty Wehrmachtu. Bilans wypadł niekorzystny, bo chociaż w półfinale zwyciężyli 4:2, to finał przegrali 2:6.
Zgodnie z hitlerowską polityką centralizacji rozgrywki piłkarskie podlegały centralnemu urzędowi jakim był Urząd ds. Piłki Nożnej (Fachamt Fuβball; pełna nazwa brzmiała: Fachamt 2 - Fußball, Rugby, Kricket) będący częścią Niemieckiego Związku Rzeszy ds. Ćwiczeń Fizycznych (Reichsbund für Leibesübungen). SV Thorn od razu wszedł więc do systemu rozgrywek istniejących już od 1933 roku (a kontynuujących wcześniejsze tradycje). Jako nowo powstały klub przydzielono go do najniższej klasy rozgrywkowej, a była nim 1. Klasse - niższa liga Okręgu Gdańsk-Prusy Wschodnie (ligą wyższą była Gauliga). Ta niższa liga podzielona była na trzy grupy (Rejencje, zwane Bezirk): gdańską, elbląską i bydgoską. Grupa bydgoska dzieliła się z kolei na cztery grupy powiatowe (Kreis): bydgoską, świecką, toruńską i w Sępólnie Krajeńskim. SV Thorn wygrał grupę toruńską rozgrywając zaledwie 3 mecze: dwukrotnie pokonał Polizei-SV Thorn i raz SG Schulitz (Solec Kujawski), na dodatek rywale nie zagrali ze sobą ani razu (został za to przyznany jeden walkower).