W latach 1938–1945 i 1948-1953 nazywał się Zespół rejonu Macharadze, w 1946-1947 Dinamo Macharadze, w 1954-1959 Kolmeurne Macharadze, w 1960 Sicharulis Macharadze. Dopiero od 1961 nosił nazwę Mercchali Macharadze. W 1959 i 1960 klub zdobył Puchar Gruzińskiej SRR, a w 1967 mistrzostwo. W 1968 debiutował w Klassie B Mistrzostw ZSRR (D3), zajmując 3.miejsce w grupie 4 Rosyjskiej FSRR. W następnym sezonie 1969 zajął 4.miejsce w grupie Zakaukazie w Klassie B (D3), a w 1970 po reorganizacji systemu lig klub został zdegradowany do Klassy B (D4). Sezon 1970 zakończył na 7.pozycji w 1 podgruppie grupy 2 Rosyjskiej FSRR i po kolejnej reorganizacji systemu lig zakwalifikował się do trzeciej ligi, zwanej Wtoraja liga (D3). We Wtoroj lidze występował w latach 1971–1975, 1983–1985, 1988–1989. W międzyczasie występował na poziomie amatorskim w mistrzostwach Gruzińskiej SRR. w 1982 zdobył Puchar Gruzińskiej SRR, a w 1982 i 1987 mistrzostwo Gruzińskiej SRR. W sezonie 1985/86 startował w Pucharze ZSRR, gdzie dotarł do 1/64 finału.