Anglikańska działalność misyjna we wschodniej Nikaragui rozpoczęła się w latach sześćdziesiątych XVII wieku, chociaż wpływy anglikańskie były obecne już w latach dwudziestych XVI wieku wśród rozproszonych brytyjskich osad handlowych i obozów dziennych na brzegu Miskito. W 1849 roku do Bluefields na misję przybyli Zjednoczeni Braci Niemieccy (Kościół Morawski). Jamajscy baptyści działali na Kornwalii w Nikaragui w latach 50. XIX wieku, a anglikanie wznowili wysiłki na brzegu Miskito w latach 80. XIX wieku. Kolejne misje przybywały w XX wieku, jednak do lat sześćdziesiątych protestanci nie zdobyli wielu wyznawców.
Przynależność religijna Ankieta przeprowadzona w czerwcu 2017, według M&R Consultants szacuje, że 46% populacji było katolikami i 33% ewangelikalnymi protestantami. 14% stanowiły osoby bez przynależności religijnej. Pozostałe religie stanowiły razem mniej niż 4% populacji i byli to: Świadkowie Jehowy, mormoni, Morawski Kościół Luterański, żydzi i muzułmanie. Morawski Kościół Luterański jest w dużej mierze skoncentrowany na północy kraju i w regionach autonomicznych południowego wybrzeża Karaibów. Większość jego członków ma pochodzenie tubylcze lub afro-karaibskie.