W czasie powodzi tysiąclecia w 1997 roku stadion znalazł się pod wodą w wyniku wylania rzeki Warty, która płynie w pobliżu stadionu; rok później został wyremontowany. Kolejną modernizację przeprowadzono w latach 2006–2009. W jej wyniku powstały m.in. nowe trybuny z około 1000 krzesełek, a część głównej trybuny uzyskała zadaszenie (105 miejsc), a także nowe nagłośnienie. W przyszłości planowane jest położenie tartanowej bieżni lekkoatletycznej.
30 marca 2004 roku odbył się tutaj mecz juniorskich reprezentacji Polski i Szwajcarii do lat 16. Wygrała reprezentacja Polski 2:0, a mecz oglądało ponad 2000 kibiców. 11 maja 2010 roku na kostrzyńskim stadionie reprezentacja Polski U-15 przegrała 0:2 w meczu towarzyskim z reprezentacją Niemiec U-15. Spotkanie przyciągnęło 1100 widzów.
24 czerwca 2017 roku rozegrano tu po raz pierwszy w historii finał Pucharu Polski na szczeblu województwa. Przeciw sobie zagrały drużyny TS Przylep (Zielona Góra) i Stilonu Gorzów Wielkopolski. Zdobywcą Pucharu Polski na szczeblu Lubuskiego ZPN został Stilon, który wygrał 2:1.