wspierać prezydencję Rady w negocjacjach na forum Rady oraz w negocjacjach z innymi instytucjami UE zapewniać wsparcie logistyczne oraz praktyczną organizację posiedzeń (m.in. sale posiedzeń, przygotowanie dokumentów i tłumaczeń) przygotowywać projekty porządków obrad, sprawozdań, not i protokołów posiedzeń na wszystkich szczeblach.
W razie potrzeby Sekretariat zajmuje się także praktyczną organizacją posiedzeń wysokiego szczebla z szefami państw i rządów lub ambasadorami państw spoza UE. Sekretariat ma też inne, bardzo specyficzne obowiązki. Wsparcie dla niektórych komitetów i grup roboczych Rady
Służba Prawna Sekretariatu wydaje opinie dla Rady i jej komitetów, tak by akty Rady były zgodne z prawem i poprawnie zredagowane. Reprezentuje ona także Radę w postępowaniach sądowych przed Trybunałem Sprawiedliwości Unii Europejskiej, Sądem oraz Sądem do spraw Służby Publicznej.
Sekretariat przewodniczy też następującym komitetom i grupom roboczym Rady Komitetowi ds. Bezpieczeństwa i jego podgrupom (zabezpieczanie informacji, eksperci ds. GNSS, rada ds. akredytacji bezpieczeństwa), Grupie Roboczej ds. Informacji, Grupie Roboczej ds. e-Prawa, Komitetowi Koordynacyjnemu ds. Systemów Informacyjno-Komunikacyjnych, Grupie Roboczej ds.