Dwa lata później wykonała premierowy koncert fortepianowy Andrzeja Panufnika. W tym samym roku Canadian Broadcasting Corporation wyprodukowała dokument telewizyjny o jej życiu i karierze, zatytułowany Świat Janiny Fialkowskiej, który był emitowany w całej Kanadzie i został nagrodzony specjalną nagrodą jury na Międzynarodowym Festiwalu Filmowym w San Francisco.
W 2002 wykryto u niej nowotwór w lewym ramieniu. Po usunięciu go poddała się zabiegowi chirurgicznemu zrekonstruowania tego ramienia. Podczas rekonwalescencji wykonała prawą ręką utwory napisane na lewą rękę przez Maurice'a Ravela (Koncert fortepianowy D-dur) i Siergieja Prokofjewa (IV Koncert fortepianowy B-dur). Zarówno publiczność, jak i krytycy chwalili jej odwagę i wysoki poziom tych występów.
W 2004 Fialkowska powróciła na scenę mając już sprawne obie ręce. Wykonała wtedy między innymi IV Koncert fortepianowy Beethovena w Toronto.
Fialkowska otrzymała także pochwałę za interpretacje dzieł Chopina i Liszta.
Życie prywatne Jest córką Bridget Todd i Jerzego Fialkowskiego, inżyniera i oficera polskiej armii, który wyemigrował do Kanady w 1945 roku. Jej matka studiowała w klasie fortepianu u Alfreda Cortota w École Normale de Musique de Paris.