10 listopada 1939 roku „Orphée” i „Antiope” wyszły w morze z Brestu, eskortowane przez pomocniczy patrolowiec „Hereux”.

14 kwietnia 1940 roku, po rozpoczęciu inwazji Niemiec na Danię i Norwegię, „Orphée” po wyjściu z Brestu dołączył do swoich siostrzanych jednostek, tworzących brytyjską 10. Flotyllę okrętów podwodnych w Harwich. Okrętem dowodził wówczas kpt. mar. (fr. lieutenant de vaisseau) R.H.A. Meynier.

19 kwietnia „Orphée” wyszedł z Harwich na swój pierwszy patrol na Morze Północne. 21 kwietnia o godzinie 23:59 załoga „Orphée” wystrzeliła na pozycji dwie torpedy w kierunku niemieckiego okrętu podwodnego U-51, jednak żadna z nich nie była celna. 24 kwietnia okręt powrócił z patrolu i wobec niemożności usunięcia usterek w miejscowej stoczni, razem z innym uszkodzonym francuskim okrętem podwodnym „Pasteur” zmuszony był udać się na remont do Francji. 3 maja o 17:00 „Orphée” oraz „Pasteur” wyszły z Dover i w eskorcie awiza „” wyruszyły do Cherbourga.

W czerwcu 1940 roku „Orphée” był nadal jednostką flagową 16. dywizjonu okrętów podwodnych, a jego dowódcą był kpt. mar. Meynier.