Taksonomia Takson ten dawniej umieszczany był w randze podrodziny w obrębie rodziny żukowatych, w grupie podrodzin laparosticti. Jako odrębną rodzinę w prezentowanym poniżej sensie zdefiniowali go w 1996 roku D. Jonathan Browne i Clarke Scholtz.
Do rodziny gnojarzowatych należy około 340 opisanych gatunków, zgrupowanych w niespełna 50 rodzajach. Ich podział do rangi plemienia przedstawia się następująco: podrodzina: Taurocerastinae Germain, 1897 podrodzina: Geotrupinae Latreille, 1802 plemię: Ceratotrupini Zunino, 1984 plemię: Enoplotrupini Paulian, 1945 plemię: †Cretogeotrupini Nikolajev, 1996 plemię: Geotrupini Latreille, 1802 plemię: Lethrini Oken, 1843
Część autorów w skład gnojarzowatych włącza również Bolboceratidae w randze podrodziny, podczas gdy inni traktują jako odrębną rodzinę (tak postąpiono w tymże artykule).
W zapisie kopalnym gnojarzowate znane są od tytonu w jurze, z którego to pochodzą skamieniałości Geotrupoides lithographicus.