We wrześniu 1939 toczyły się tu walki oddziałów osłaniających wycofującą się za Wisłę Armię „Prusy”. 10 września 1939 odbyła się bitwa o Głowaczów, w której walczyła 13 Kresowa Dywizja Piechoty wspomagana przez 1 Batalion Czołgów Lekkich. Podczas bitwy zniszczono przynajmniej dwa niemieckie czołgi, a w rezultacie walk Niemcy wycofali się za RadomkęKrzysztof Urbański Zagłada Żydów w dystrykcie radomskim s. 23, za Czesławem Zwolskim.. Głowaczów został poważnie zniszczony podczas kampanii wrześniowejKrzysztof Urbański op. cit. s. 58..
Pewną liczbę Żydów z Głowaczowa wywieziono do obozów pracy w dystrykcie lubelskim w 1940Krzysztof Urbański op. cit. s. 63.. Wiosną 1940 mieszkańcy Głowaczowa, a więc i Żydzi, zostali wysiedleni w związku z budową poligonu lotniczego w okolicy. Żydów przeniesiono na nieużytki między Jasieńcem a Mariampolem, gdzie żyli w prowizorycznych budach z dykty, blachy itp.Krzysztof Urbański op. cit. s. 137, za Lipcem. Rozlokowanie przesiedleńców odbyło się przy udziale i wedle wskazań Naczelnej Rady Starszych z RadomiaKrzysztof Urbański op. cit. s. 85.. W drugiej połowie sierpnia 1942 Żydów z Głowaczowa przeniesiono do getta w KozienicachKrzysztof Urbański op. cit. s.