Wobec nieprzydłużenia umowy profesorskiej na uniwersytecie w Madison, Carrowie przeprowadzili się do Kalifornii i zamieszkali w Oakland.
Od 1867 do 1873 r. Ezra Carr prowadził wykłady z rolnictwa na Uniwersytecie Kalifornijskim w Berkeley, publikując równocześnie wiele artykułów z zakresu chemii i rolnictwa. Jako pierwszy na tej uczelni profesor rolnictwa skupiał się raczej na kwestiach praktycznych, służących bezpośrednio ulepszeniu metod upraw ziemi, niż na zagadnieniach teoretycznych. W 1873 r. wdał się w kontrowersyjną działalność zmierzającą do reorganizacji samego uniwersytetu, co doprowadziło do utraty stanowiska. Kolejnym nieszczęściem tego roku była śmierć pierwszego syna, Ezry juniora (Neda) w wyniku powikłań po chorobie, której nabawił się podczas pobytu w Amazonii. Od 1875 r. przez pięć lat Ezra Carr pełnił funkcję kuratora oświaty stanu Kalifornia (California State Superintendent of Public Instruction). W 1876 r. Carrowie przeprowadzili się do Pasadeny, gdzie osiedli na 43-arowej posiadłości Carmelita, zbudowawszy tam dom, wokół którego Jeanne Carr założyła ogród z wieloma egzotycznymi gatunkami roślin (obecnie tereny Muzeum Norton Simon). Przez kilka lat z sukcesem prowadziła plantację i eksport pomarańcz, ale bez wystarczających efektów finansowych.